Pokémon GO 宣佈在第 6 和第 7 世代寶可夢遊戲登場的「 超級進化 」加入本作。在本作，訓練家們可以使用「超級能量」讓寶可夢「超級進化」。「超級能量」要從「超級團體戰」之中吸收，你需要盡量以短時間打敗超級進化寶可夢，獲得越多超級能量。

能夠使用「超級進化」的寶可夢很多，但目前 Pokémon GO 支援「超級進化」的暫時只有奇異花、噴火龍、水箭龜，牠們也會出現在超級團體戰之中。未來會有更多寶可夢大針蜂、大比鳥支援「超級進化」，但未淨化前的暗影寶可夢無法「超級進化」。[the_ad_placement id=”ad2″]

留意的是只限一隻寶可夢進行「超級進化」，多於一隻的話先前「超級進化」的寶可夢會打回原形。而「超級進化」過的寶可夢下次「超級進化」使用的「超級能量」減少。

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在本作你只需「超級能量」就能讓寶可夢「超級進化」，但商店仍然提供當年「超級進化」所需要的「GO超級手鐲」作服裝飾品。

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